La pianta del complesso è formata dall'accorpamento di due distinti complessi: quello della Cittadella che si sviluppa a U e della parte incompiuta del Palazzo Farnese pure a U; i due corpi sono collegati fra loro da elementi costituenti la cinta muraria originale con due torri circolari; cortile interno; fossato in parte interrato; la muratura esterna è in mattoni a vista, quella interna è in parte in mattoni a vista e in parte trattata ad intonaco; piano interrato sotto la Cittadella; seminterrato sotto il Palazzo Farnese