La scena di martirio è tipologicamente connessa alla leggenda che in Jacopo da Varazze così racconta: "Quando la Vergine, seppe della battaglia che la stava attendendo [il testo si riferisce alla disputa dialettica con i filosofi], si mise nelle mani del Signore, ed ecco che un Angelo del Signore le si pose accanto e le disse di rimanere salda, e che fosse certa, non solo di potere essere vinta da quei sapienti, ma che anzi li avrebbe convinti e li avrebbe condotti alla palma del martirio". Il martirio comunque ebbe luogo, per tutti i sapienti convertiti alla fede. Leggiamo infatti nella leggenda aurea che i Sapienti "ebbero il tempo di guarnirsi del segno della croce e furono gettati nelle fiamme. Tanto profondamente si votarono a Dio che il fuoco non danneggiò in nulla i loro corpi. La scena del martirio è puntualmente rievocata nel primo riquadro della parete nord a partire dalla controfacciata