L'affresco, episodio conclusivo della vita del Frate, segue fedelmente, secondo quanto ha stabilito Anna Maria Amonaci (1989), la descrizione della morte del Santo narrata da Marco da Lisbona (1582, II, p. 260). Francesco è rappresentato disteso in primo piano sulla terra nuda, ricoperto soltanto da un piccolo lembo di lenzuolo in vita e con la testa riversa su una pietra, tutte componenti che evidenziano ancora una volta la sua condotta di vita incentrata sulla miseria, l'umiltà e la penitenza. La sua mano sinistra poggia umilmente sulla ferita del costato, mentre con la destra accenna a un gesto di benedizione. Raffigurati in parte ginocchio in parte in posizione eretta, due gruppi di confratelli e funzionari religiosi si stringono in raccoglimento attorno al Santo. Sullo sfondo altre figure, tra cui spicca quella femminile riconosciuta nella nobildonna romana Iacopa de' Settesoli, e, nella parte alta della lunetta, in un volo composto ed equilibrato due angioletti porgono l'ultimo saluto al frate portando con se, una corona di fiori e la palma del martirio. La scena, dal tono solenne e al contempo moderato, è trattata dal Ferrucci con quella pacatezza e semplicità formale che contraddistinguono non soltanto il suo stile pittorico, ma il genere della pittura devota