Tre finestre con centina ricurva, su entrambi i lati della navata, nella zona superiore, sono affiancate da due figure e decorate, nell'unghia superiore, da putti che reggono vasi di fiori alternati a grande conchiglia con festoni di frutti legati da nastri azzurri. Fra ogni finestra si alzano prospettive di loggiato su alte colonne lisce, con alto basamento con cartella monocroma grigia e capitello composito; dalla balconata si affacciano numerose figure in vesti policrome e in attitudini diverse, con libri e strumenti scientifici. Ai quattro estremi sono dipinte figure isolate simboliche, in monocromia. Le prospettive laterali inquadrano la ricca pittura della volta, che porta al centro tre "Storie di San Paolo" (cfr. la scheda), inserita in un decoro monocromo giallo, con cartelle di raccordo, festoni floreali, frutti e figure. Sopra le finestre sono dipinte coppie di figure monocrome: al centro due angeli, ai lati due telamoni