Lo strumento dei passaggi serve alla determinazione del tempo mediante l'osservazione del transito in meridiano di una stella e la successiva verifica che la sua ascensione retta corrisponda all'ora segnata in quel momento dall'orologio a tempo siderale. Esso consiste di un cannocchiale in grado di ruotare intorno all'asse est-ovest e, di conseguenza, in grado di compiere osservazioni esclusivamente lungo il meridiano locale. Notevole la grande livella invertibile, ancora riempita dal suo fluido. Solo da pochi anni, infatti, la tecnica di alesatura dei tubi di vetro aveva consentito di ottenere dalle livelle a bolla la sensibilità richiesta per la messa in stazione degli strumenti astronomici. E' stato rimesso in stazione nel 1979 tra le ricostruite colonne che, secondo Zanotti, erano "d'ordine dorico in quella proporzione che soddisfacesse al bisogno, ed insieme all'eleganza" (Annotazione di mano dello Zanotti in Reg. Sp. Ist. Scienze Bo., vol. VII, alla data 16 Agosto 1742, Arch. Dip. Astron. Bo.). Gli appoggi murati alle colonne e l'asta di legno che collega la parte oculare dello strumento al fuso inferiore, assicurandone la posizione in altezza, sono anch'esse state restaurate nello stesso anno. Sono anche stati rimessi i fili del micrometro trovati spezzati ed il riflettente che pare originale. Sul tubo reca la scritta: Jonathan Sisson London. Sull'obiettivo si legge JaS, Mann Fecit 1739