Controsoffitto, ancorato alle preesistenti capriate, intagliato a cassettoni cruciformi, rettangolari e quadrati; lungo l'asse longitudinale sono disposti tre lacunari cruciformi più grandi che contengono, a partire dalla facciata: gli stemmi papali di Pio V e di Gregorio XIII, incorniciati da ovali con festoni e testine angeliche e, al centro fra di essi, Madonna con Bambino entro un ovale di cherubini e nuvole. Alternati a questi, entro cassettoni cruciformi sono due stemmi del Comune di Roma, affiancati da due angeli e inseriti in un ottagono. Negli altri cassettoni compaiono motivi decorativi vegetali, navi e trofei di armi. Il soffitto è incorniciato da una teoria di mensole, alternate a rosette e si conclude con un fregio che corre al sommo delle pareti della navata, realizzato in legno intagliato e dorato, con draghi, rostri, lupe, delfini e sirene. Sulla parete dell'arco trionfale il fregio è sostituito da una lunga iscrizione dipinta su legno