San Francesco con un ginocchio posto sulla pietra è colpito da raggi di luce che scendono dal cielo provocandogli le stigmate e l’estasi. L’ambientazione è all’aperto in una selva caratterizzata da un viottolo in mezzo a due rupi. Sullo sfondo a sinistra si intravede la sagoma di frate Leone. In primo piano, a terra, sono posti il libro, il cartiglio e il teschio. Il dipinto è una precisa ripresa dell’incisione di Agostino Carracci