L'ambientazione della scena è in notturno. Poggiato ad un albero e seduto, in basso a destra, si vede frà Leone che con la destra si ripara gli occhi dalla forte luce che scende dall'alto. Un secondo piano, a destra, inginocchiato, è San Francesco. Ha le braccia spalancate e sta ricevendo le stiimate dal cherubino che è apparso in alto contornato da un aluce accecante. Nel fondo, oltre le rocce e gli alberi, si scorgono Caino e Abele e, più oltre, la chiesa dei cappuccini di Urbino