La Madonna con il Bambino tra le braccia siede su un alto gruppo di nuvole, il suo sguardo è rivolto in basso, verso S. Francesco. Il Santo si trova a destra della composizione, inginocchiato su una roccia e guarda in alto verso il Bambin Gesù, tenendo le mani strette al petto. Accanto a lui il teschio e il flagello. A sinistra due angioletti sembrano giocare tra un panneggio svolazzante