La decorazione in stucco della cupola del presbiterio si concentra nei quattro pennacchi, ove si trovano cornici polilobe, e nel tamburo della volta. In quest'ultimo si trovano, in corrispondenza delle già ricordate cornici sottostanti, altre cornici che racchiudono grandi conchiglie in stucco, poi affrescate dal Quaglio con figure allegoriche. Nei lati corrispondenti agli archi che dividono il presbiterio dalla navata e dall'abside il Camuzio realizzò anche quattro angeli