L'edificio attualmente si presenta come un fabbricato degli inizi del secolo di sapore Umbertino temperato da suggestioni razionaliste, che nella sua disposizione planimetrica tradisce il suo impianto neoclassico. La costruzione, dall'aspetto pacato, si dispone con un lungo corpo orizzontale articolato su due piani verso i bastioni Pigafetta, che ne costituisce il prospetto principale. Nel corpo centrale si apre il portone principale leggermente in aggetto e sormontato da un attico con andamento curvilineo sul portale, che unitamente agli spigoli del fabbricato con paramento in aggetto costituiscono gli unici elementi che modulano chiaroscuralmente la lunga facciata. Il complesso ospedaliero ha incorporato nel suo ambito le strutture residue dell'antica sinagoga ebraica, che venne trasformata in chiesa cristiana dopo il 1498 e della quale era ancora visibile la parte absidale nel sette-ottocento e della quale rimane memoria anche nella toponomastica della piazza S. Croce che costituisce uno dei limiti del complesso