L'impianto è costituito da sette vasche allineate, di forma quadrangolare, realizzatesul versante sud dell'isola, in muratura di scheggioni di pietra legati con malta idraulica e rivestite da cocciopesto che si presenta bombato in corrispondenza degli spigoli. Sulla punta est dell'isola alcune cavità  della scogliera sono state adattate a vivaio, realizzando muri di chiusura; le tracce nella roccia segnalano la presenza di pali (forse per un pontile) e di paratie lignee per il periodico svuotamento delle vasche. I reperti rinvenuti fanno datare l'attività  della peschiera tra il II secolo a.C. ed il VI secolo d.C.; a partire dal VII secolo si installa su Santo Ianni una piccola comunità  religiosa le cui sepolture sono adiacenti ad una cappella absidata costruita nel punto pi๠alto dell'isola