L'altare, poggiante su un alto basamento rettangolare, mostra una vistosissima decorazione: ai lati si dispongono motivi floreali, nastri e puttini, mentre la campata centrale è occupata da due colonne, dotate di plinto toro e capitelli compositi, che inquadrano la nicchia contenente le statue di San Raffaele ed Isacco. La nicchia è incorniciata da un motivo a zig-zag, su cui si dispone la scultura di un puttino e da intarsi policromi. Le colonne sorreggono una trabeazione con architrave, fregio e cornice, conclusa da un timpano ornato agli spigoli da teste alate di cherubini e dalla croce terminale. La mensa, di forma rettangolare, è decorata con riquadri policromi, e mostra al centro una spada ed una lancia che si incrociano tra una corona di fiori ed un nastro recante il nome dell'Arcangelo