Il santo titolare è affiancato da S. Biagio vescovo patrono della pievania e da S. Antonio abate. Il paesaggio si appiattisce in una sorta di terrazza rocciosa, la sommità di un nuovo Golgota, sul ciglio si allineano i personaggi oltre i quali si scorge in lontananza uno specchio d'acqua e una landa scura: forse una città, l'antica Gerusalemme, o la Roma di Diocleziano col Campo Marzio dove, secondo Jacopo da Varagine, avvenne il martirio di Sebastiano; oppure Firenze vista dall'Arno. Ai lati di S. Sebastiano, due angeli accorrono in volo, con la corona e la palma del martirio. Si noti la differenza stilistica dei due arcieri intenti a scoccare i dardi sacrificali: esiste un'incongruenza tra i corti dardi da balestra conficcati nel corpo del santo e quelli impugnati con fatica dai due armigeri di lunghezza esagerata come gli archi stessi. Le due figure minori, arcaicamente dipinte in dimensione ridotta rispetto a quella dei santi, risultano indurite