L'altare è costituito da una mensa a bulbo, con un paliotto marmoreo con tre tondi raffiguranti la Madonna, Cristo, San Giovanni, sormontata da tre ordini di gradoni formanti una leggera concavità, il primo dei quali sorretto da due aquile con lo stemma di Savona tra gli artigli. Il ciborio al centro è a forma di tempietto ottagonale, con alto ordine di colonne marmoree libere e agli spigoli, con due timpani triangolari sul fronte e sul retro, e concluso da una cupola su un breve tamburo. Al centro di ogni lato, in nicchia, una statua di santo in bronzo dorato, a tutto tondo. Sul lato verso la navata, sopra la porticina dell'ostensorio, piccolo rilievo in bronzo dorato con l'Ultima Cena