Nel catino absidale, intorno alla semplice porta di accesso alla sacrestia, vi sono affreschi con storie di Santa Margherita. La ghiera dell'arco ha un motivo vegetale affrescato. A sinistra dell'arco vi sono due Madonne. Sopra l'abside si apre una stretta finestra, le cui pareti strombate sono affrescate, come tutta la fascia alta della parete. Una cornice vegetale con motivi classici corre nella zona più alta