L'arca di Sant'Apollonio, forse in origine dorsale d'altare, consta di un largo basamento scolpito con festoni, che poggia su quattro mensole di marmo terminanti con teste di cherubino. Nella faccia anteriore sono scolpiti tre scomparti, il centrale leggermente più largo, di altezza uguale, separati da lesene scolpite e sormontati da un largo fregio a volute di fiori con centauri. Due scomparti scolpiti decorano le facce laterali. Sopra, al centro, la statua di Sant'Apollonio, entro un'edicola architravata. Più in alto, entro centina scolpita e decorata, la Vergine col Bambino e angeli a tutto rilievo. Al centro, sotto la statua, un'iscrizione. Ai lati, su cornucopie, i santi Faustino e Giovita. Nei pannelli sono raffigurati: a sinistra, predica di Sant'Apollonio; al centro, la messa dei Sant'Apollonio; a sinistra, Sant'Apollonio battezza i fedeli, tra i quali San Faustino e San Giovita. Ai lati due altri episodi: a sinistra il Santo impone la veste talare ai Santi patroni, a destra il funerale del Santo