Situato a nord-est rispetto a Foggia. Presenta funzioni di culto, di frequentazione, produttive, artigianali e residenziali. I collegamenti interni sono pedonali e carrabili. Nello specifico, Cagnano Varano si trova nella porzione nord del Gargano, a 165 s.l.m. Fa parte del Parco Nazionale del Gargano. La zona del centro storico comprende il Palazzo Baronale e la Chiesa Madre. Gli edifici del centro storico attualmente esistenti risalgono al XVII-XVIII secolo e si estendono sia nel centro storico denominato “Cav’ut” sia nel Casale. Il paese si è espanso verso sud rispetto al Palazzo Baronale, seguendo le attuali Corso Roma e Corso Umberto I, primo tratto di corso Giannone, già nel corso del XVI secolo. Le abitazioni del centro storico sono disposte in modo da facilitare il defluire delle acque metereologiche verso la valle, mentre la vicinanza delle abitazioni una all’altra è dovuta al voler trovare riparo al forte vento proveniente dal mare, che spira sia in inverno che in estate. Le abitazioni sono caratterizzate dal colore bianco delle pareti esterne, ottenuto attraverso l’intonacazione in calce, retaggio del passato per motivi igienici. L'abitato moderno di Cagnano Varano si sviluppa a partire dal nucleo originario di età Medievale, seguendo il declivio sul quale si affaccia la porta di accesso al borgo medievale. A partire dall'età Moderna, anche gli edifici presenti nel borgo medievale hanno subito manomissioni e ristrutturazioni. L’abitato attuale si è sviluppato verso ovest, lungo i due assi principali costituiti da via G. Marconi e corso P. Giannone